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菌落總數(shù)、大腸菌群、大腸桿菌、霉菌、酵母菌、致病菌、沙門氏菌、單核增生李斯特氏菌、志賀氏菌、金黃色葡萄球菌、副溶血性弧菌、霍亂弧菌、創(chuàng)傷弧菌、彎曲桿菌屬、阪崎腸桿菌、綠膿桿菌、溶血性鏈球菌、肉毒梭菌、產(chǎn)氣莢膜梭菌、蠟樣芽孢桿菌、大腸埃希氏O157：H7/NM、致瀉大腸埃希氏菌、溶藻弧菌、軍團(tuán)菌、乳酸菌、罐頭食品的商業(yè)無菌、腸桿菌科、嗜滲酵母、糞鏈球菌、糞大腸菌群、腸桿菌屬、厭氧菌落總數(shù)、厭氧亞硫酸鹽還原菌、需氧嗜溫菌芽孢、厭氧嗜溫菌芽孢、嗜熱嗜酸菌、嗜熱菌落總數(shù)、白色念珠菌
常規(guī)鑒定
常規(guī)鑒定內(nèi)容有形態(tài)特征和理化特性。形態(tài)特征包括顯微形態(tài)和培養(yǎng)特征；理化特性包括營養(yǎng)類型、碳氮源利用能力、各種代謝反應(yīng)、酶反應(yīng)和血清學(xué)反應(yīng)等。
自動鑒定
BIOLOG鑒定系統(tǒng)以微生物對不同碳源的利用情況為基礎(chǔ)，檢測微生物的特征指紋圖譜，建立與微生物種類相對應(yīng)的數(shù)據(jù)庫。通過軟件將待測微生物與數(shù)據(jù)庫參比，得出鑒定結(jié)果。該系統(tǒng)已獲美國FDA認(rèn)可，已逐步應(yīng)用于食品和飲品企業(yè)、環(huán)保、海洋生物/水產(chǎn)品、制藥、農(nóng)業(yè)微生物、生物治理、化妝品、臨床等領(lǐng)域的微生物鑒定試驗中。 啟標(biāo)檢測機(jī)構(gòu)擁有國內(nèi)最全的BIOLOG數(shù)據(jù)庫，涉及革蘭氏陰性菌、革蘭氏陽性菌、厭氧菌、酵母、絲狀真菌在內(nèi)近2000種微生物。
分子生物學(xué)鑒定
應(yīng)用分子生物學(xué)方法從遺傳進(jìn)化角度闡明微生物種群之間的分類學(xué)關(guān)系，是微生物分類學(xué)研究普遍采用的鑒定方法。啟標(biāo)檢測機(jī)構(gòu)擁有微生物菌種分類鑒定的分子生物學(xué)實驗室，配有PCR儀、高速冷凍離心機(jī)、電泳儀、HPLC、凝膠成像系統(tǒng)、紫外控溫分析系統(tǒng)等先進(jìn)儀器設(shè)備，以及DNAMAN、BIOEDIT、CLUSTALX、TREEVIEW等序列分析軟件。CICC可采用核酸序列分析法分析細(xì)菌16S rDNA/16S-23S rDNA區(qū)間序列、酵母18S rDNA/26S rDNA（D1/D2）序列及絲狀真菌的18S rDNA/ ITS1-5.8S-ITS2序列，提供科學(xué)的鑒定結(jié)果。
API細(xì)菌鑒定
API鑒定系統(tǒng)涵蓋15個鑒定系列，約有1000種生化反應(yīng)，已可鑒定超過600種的細(xì)菌。鑒定過程中，可根據(jù)細(xì)菌所屬類群選擇適當(dāng)?shù)纳砩b定系列，通過軟件將待測細(xì)菌與數(shù)據(jù)庫參比，得出鑒定結(jié)果。 啟標(biāo)檢測機(jī)構(gòu)可應(yīng)用API 50CH系列、API 20 E系列、API Staph系列對乳酸桿菌（Lactobacillus sp.）和相關(guān)細(xì)菌、芽孢桿菌（Bacillus sp.）、葡萄球菌屬（Staphylococcus sp.）、微球菌屬（Micrococcus sp.）和庫克菌屬（Locuria sp.）進(jìn)行鑒定。
技術(shù)分析
功能性分析及功能基因不斷致力于工業(yè)微生物資源的功能及其功能基因研究，通過木聚糖酶、纖維素酶、葡萄糖異構(gòu)酶、β-甘露聚糖酶等功能基因的克隆進(jìn)行菌種產(chǎn)酶的功能性分析。應(yīng)用gyrA、atpD及pheS等看家基因于微生物菌種鑒定，在某些種、亞種、株間有較好的分辨效果。
RAPD、SSCP技術(shù) 隨著微生物菌種應(yīng)用的進(jìn)一步發(fā)展，在食品安全管理、生物產(chǎn)品出口認(rèn)證、知識產(chǎn)權(quán)保護(hù)等行業(yè)需求日益增加，微生物菌種株水平的鑒別技術(shù)成為一個迫切需要解決的問題。 采用隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA（Randomly amplified polymorphism DNA，RAPD）技術(shù)和單鏈構(gòu)象多態(tài)性(Single Strand Conformation Polymorphism，SSCP）技術(shù)對微生物菌株進(jìn)行鑒別。如采用RAPD技術(shù)能夠?qū)ν痪N原始菌株與誘變菌株進(jìn)行鑒別，對誘變菌株知識產(chǎn)權(quán)保護(hù)具有重要意義；采用SSCP技術(shù)進(jìn)行工業(yè)酒精酵母菌株的鑒別，此技術(shù)結(jié)合菌株發(fā)酵特性，在酒類生產(chǎn)的質(zhì)量控制方面起到積極作用。
TLC薄層層析將TLC薄層層析技術(shù)應(yīng)用于微生物菌種鑒定，進(jìn)行細(xì)菌、放線菌細(xì)胞壁化學(xué)組分分析（氨基酸、糖），作為劃分屬特征的重要鑒定技術(shù)手段，起到了良好的輔助作用。
全細(xì)胞脂肪酸分析鑒定系統(tǒng) 采用Sherlock全自動細(xì)菌鑒定系統(tǒng)，通過對不同菌株的脂肪酸圖譜進(jìn)行分析，并與標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對，來鑒定細(xì)菌及酵母。該技術(shù)是細(xì)菌或酵母種水平鑒定的有效手段之一。（9）（G+C）mol%及DNA/DNA雜交 通過采用DU800核酸蛋白分析儀測定Tm值，從而得到微生物菌株的（G+C）mol%，并與模式菌株進(jìn)行DNA/DNA同源性分析，該鑒定技術(shù)手段是多相鑒定的重要組成部分。
GB/T 29888-2013
